独奉圣朝朔，
 来开盘古荒。

 周懋琦撰正殿联。圣前：前朝。即指明朝。朔：一月的第一天。明末桂王朱榔后即帝位，改元“永历”，新定正朔。郑成功即奉“永历”的正朔。盘古：我国神话中开天辟地首出创世的人。即盘古氏。

 毗舍之间开一域，
 厓山而后矢孤忠。

 袁闻诉撰正殿联。作者为光绪时台湾知府。江西乐平人。毗舍：即毗舍耶，为宋元时台湾东部岛国，曾被误指台湾。厓山：即厓门山，在广东省新会。宋末张世杰守此，败于元，陆秀夫负帝沉于海。孤忠：忠心耿耿而不得支持。

 钟河岳之灵，为胜朝绵正溯；
 遵海滨而处，知中国有圣人。

 吴延华撰正殿联。作者为清时台湾邑令。胜朝：前朝，即明朝。圣人：谓道德、智能极高的人。

 返日共挥戈，沧海楼船拼转战；
 余生皆裹革，秋风铁马尚来归。

 陈谟撰左殿(宁靖王祠)厢庑联。厢庑祀明季忠义之士一百一十四人。作者为清台湾学者，任崇文书院院长。

 生为遗臣，殁为正神，独有千古；
 今受大名，昔受赐性，谅哉完人。

 张其光撰正殿联。遗臣：指郑成功，他收复台湾时明已亡。赐性：明隆武帝赐郑成功“朱”姓，号“国姓爷”。

 值明运穷时，故英灵不毓中土；
 辟炎方创局，惟烈母乃生佳儿。

 周懋琦撰后殿联。后殿祀郑成功母翁太妃。作者为清钱塘人。曾任台湾知府。炎方：南方。

 孤臣秉孤忠，浩气磅礴留千古；
 正人扶正义，莫教成败论英雄。

 孤臣：封建王朝中孤立无助的臣子。

 忠节感苍穹，大海忽将孤岛现；
 经纶关运会，全山留与后人开。

 王泰运撰正殿联。作者为清时福建巡抚。苍穹：苍天。孤岛：即台湾。经纶：整理丝缕。引申为处理国事。运会：时运际会。

 真能收明运之终，不与诸王事位号；
 是足见天心所寄，未曾一女负纲常。

 陈谟撰左殿联。未曾一女：指宁靖王朱衍桂之五妃缢同殉夫事。

 土宇辟沧溟，移孝作忠，天为孤臣留片壤；
 血诚矢皦日，愿心略迹，帝颁旷典报馨香。

 方祖荫撰正殿联。矢：同“誓”。皦日：明亮的太阳。原心：推究其本心。略迹：撇开表面的事实。旷典：稀有难逢的大典。

 东海望台彭，风景不殊，举目有河山之异；
 南天留祠宇，雄图虽渺，称名则妇孺皆知。

 许世英撰正殿联。作者曾任国民党政府外交部长。

 惟君克振祖风，乃使骨肉情中生许多媒孽；
 有妇能完夫志，求之须眉队里恐无此从容。

 陈谟撰右殿(监国祠)联。祠祀郑经之子。其子被立为监国，后遇害，娶妻陈氏。媒孽：构陷。须眉：男子。

 英雄应厄运而生，赤手擎天，存故国四十年正朔；
 开辟在神州以外，红毛避地，启遐荒百万众提封。

 王懋官撰正殿联。神州：此指大陆。红毛：指荷兰侵略者。提封：封地：封地。此指领土。

 赐国姓，家破君亡，永矢孤忠，创基业在山穷水尽；
 复父书，词严义正，千秋大节，享俎豆于舜日尧天。

 刘铭传撰正殿联。

 开万古得未曾有之奇，洪荒留此山川，作遗民世界；
 报一生无可如何之遇，缺撼还诸天地，是创格完人。

 沈葆桢撰正殿联。作者清福建闽侯人，官至船政大臣，为林则徐之婿。洪荒：指远古时代。遗民：指易代后不仕新朝的人。
 遇：知遇之恩。指明隆武帝赐郑成功朱姓事。
 缺憾：深感遗憾。指郑成功反清复明之志未酬，在围南京时失利，失败而还，病卒台湾。创格：第一等的风度品格。

 由秀才封王，主持半壁旧河山，为天下读书人顿生颜色；
 驱外夷出境，开辟千秋新事业，愿中国有志者再鼓雄风。

 唐景崧、丘逢甲撰正殿联。由秀才封王：郑成功为南明弘光时监生，后桂王封他为延平郡王、招讨大将军。半壁：郑成功的兵力曾控制福建、广东、浙江、江苏沿海地区。清丘逢甲《有感赠义军旧书记》诗云“撑起东南天半壁，人间还有郑延平。”外夷：指侵占台湾的荷兰殖民者。

 天地间有大纲，耿耿孤忠，守正朔以挽虞渊，只自完吾气节；
 今古来为创局，茫茫荒岛，启沃壤而新版宇，犹思当日艰难。

 夏献纶撰正殿联。作者为清同治年间台湾道台。虞渊：日落处。喻指明亡。

 当山河破碎之时，以海岛抗中原，百折不回，天命有归标大节；
 处骨肉分离而后，以孝思为忠荩，千秋共谅，此心无愧即完人。

 何如瑾撰。荩：忠诚。

 纵绝岛别开生面，移山填海，三百年社稷系以存亡，仿箕子，比田横，志士苦心，特向胶庠留气节；
 是胜代第一完人，起敝扶衰，十七载勋猷明同日月，填滇海，连浙水，英雄无命，长悬肝胆照波涛。

 陈谟撰正殿联。箕子：商代贵族，纣王诸父，官太师，封于箕(今山西太谷)。曾劝谏纣王，不听，被囚，周灭商被释。田横：汉初齐国贵族。楚汉战争自立齐王，后为汉所破。他不愿称臣于汉，遂率五百徒党逃亡海岛，不受汉高祖命诏而自杀。胶庠：古代学校。勋猷：功债。此指郑成功收复台湾后建立行政机构，开荒屯田，发展生产等。填滇南连浙水：郑成功曾联合云南的李定国，浙江的张煌言一起抗清。英雄无命：郑成功收复台湾后五个月即病逝。